Draft Genome Sequence of Providencia heimbachae, Isolated from a Diabetic Foot Ulcer

Joanne Jneid; Samia Benamar; Isabelle Pagnier; Pierre-Yves Levy; Jean-Philippe Lavigne; Bernard La Scola

doi:10.1128/genomeA.00276-16

Draft Genome Sequence of Providencia heimbachae, Isolated from a Diabetic Foot Ulcer

Genome Announc. 2016 Apr 14;4(2):e00276-16. doi: 10.1128/genomeA.00276-16.

Authors

Joanne Jneid¹, Samia Benamar¹, Isabelle Pagnier¹, Pierre-Yves Levy², Jean-Philippe Lavigne³, Bernard La Scola⁴

Affiliations

¹ Faculté de Médecine, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, CNRS, UMR 6236-IRD 198, Aix-Marseille Université, Marseille, France.
² Fédération de Bactériologie-Virologie-Hygiène, Assistance Publique Hôpitaux de Marseille, Hôpital de la Timone, Marseille, France.
³ Service de Microbiologie, CHU Caremeau, Nîmes, France INSERM, U1047, Université de Montpellier, Nîmes, France.
⁴ Faculté de Médecine, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, CNRS, UMR 6236-IRD 198, Aix-Marseille Université, Marseille, France Fédération de Bactériologie-Virologie-Hygiène, Assistance Publique Hôpitaux de Marseille, Hôpital de la Timone, Marseille, France bernard.la-scola@univ-amu.fr.

Abstract

Providenciaspp. are ubiquitous Gram-negative bacteria of the familyEnterobacteriaceaethat are common opportunistic pathogens. In the present work, we have sequenced, annotated, and compared the draft genome ofProvidencia heimbachae, which was recovered from a diabetic foot ulcer. It is composed of 4.22 Mb and encodes 3,843 protein-coding genes and 79 RNA genes, including 11 rRNA genes.