Permanent Draft Genome Sequence for Frankia sp. Strain CeD, a Nitrogen-Fixing Actinobacterium Isolated from the Root Nodules of Casuarina equistifolia Grown in Senegal

Mariama Ngom; Rediet Oshone; Sheldon G Hurst 4th; Feseha Abebe-Akele; Stephen Simpson; Krystalynne Morris; Mame Ourèye Sy; Antony Champion; W Kelley Thomas; Louis S Tisa

doi:10.1128/genomeA.00265-16

Permanent Draft Genome Sequence for Frankia sp. Strain CeD, a Nitrogen-Fixing Actinobacterium Isolated from the Root Nodules of Casuarina equistifolia Grown in Senegal

Genome Announc. 2016 Apr 7;4(2):e00265-16. doi: 10.1128/genomeA.00265-16.

Affiliations

¹ University of New Hampshire, Durham, New Hampshire, USA Laboratoire Mixte International Adaptation des Plantes et Microorganismes Associés aux Stress Environnementaux (LAPSE), Centre de Recherche de Bel Air, Dakar, Sénégal Département de Biologie Végétale, Laboratoire Campus de Biotechnologies Végétales, Faculté des Sciences et Techniques, Université Cheikh Anta Diop, Dakar, Dakar-Fann, Sénégal Laboratoire Commun de Microbiologie IRD/ISRA/UCAD, Centre de Recherche de Bel Air, Dakar, Sénégal.
² University of New Hampshire, Durham, New Hampshire, USA.
³ Laboratoire Mixte International Adaptation des Plantes et Microorganismes Associés aux Stress Environnementaux (LAPSE), Centre de Recherche de Bel Air, Dakar, Sénégal Département de Biologie Végétale, Laboratoire Campus de Biotechnologies Végétales, Faculté des Sciences et Techniques, Université Cheikh Anta Diop, Dakar, Dakar-Fann, Sénégal.
⁴ Laboratoire Mixte International Adaptation des Plantes et Microorganismes Associés aux Stress Environnementaux (LAPSE), Centre de Recherche de Bel Air, Dakar, Sénégal Laboratoire Commun de Microbiologie IRD/ISRA/UCAD, Centre de Recherche de Bel Air, Dakar, Sénégal Institut de Recherche pour le Développement (IRD), UMR DIADE, Montpellier, France.
⁵ University of New Hampshire, Durham, New Hampshire, USA louis.tisa@unh.edu.

Abstract

Frankiastrain CeD is a member ofFrankialineage Ib that is able to reinfect plants of theCasuarinafamilies. Here, we report a 5.0-Mbp draft genome sequence with a G+C content of 70.1% and 3,847 candidate protein-encoding genes.