[Prevalence and risk factors for extended-spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli causing community-onset urinary tract infections in Colombia]

Enferm Infecc Microbiol Clin. 2016 Nov;34(9):559-565. doi: 10.1016/j.eimc.2015.11.017. Epub 2016 Jan 13.
[Article in Spanish]

Abstract

Introduction: Urinary tract infections (UTI) are common in the community. However, information of resistant isolates in this context is limited in Latin America. This study aims to determine the prevalence and risk factors associated with community-onset UTI (CO-UTI) caused by extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-Producing Escherichia coli in Colombia.

Materials and methods: A case-control study was conducted between August and December of 2011 in three Colombian tertiary-care institutions. All patients who were admitted to the Emergency Department with a probable diagnosis of CO-UTI were invited to participate. All participating patients were asked for a urine sample. ESBL confirmatory test, antibiotic susceptibility, and molecular epidemiology were performed in these E.coli isolates (Real Time-PCR for bla genes, repetitive element palindromic PCR [rep-PCR], multilocus sequence typing [MLST] and virulence factors by PCR). Clinical and epidemiological information was recorded, and a statistical analysis was performed.

Results: Of the 2124 recruited patients, 629 had a positive urine culture, 431 of which grew E.coli; 54 were positive for ESBL, of which 29 were CTX-M-15. The majority of ESBL isolates were susceptible to ertapenem, phosphomycin and amikacin. Complicated UTI was strongly associated with ESBL-producing E.coli infections (OR=3.89; 95%CI: 1.10-13.89; P=.03). CTX-M-15-producing E.coli showed 10 different pulsotypes, 65% were PT1 or PT4, and corresponded to ST131. Most of these isolates had 8 out of the 9 analysed virulence factors.

Discussion: E.coli harbouring blaCTX-M-15 associated with ST131 is still frequent in Colombia. The presence of complicated CO-UTI increases the risk of ESBL-producing E.coli, and must be taken into account in order to provide an adequate empirical therapy.

Introducción: Las infecciones del tracto urinario (ITU) son frecuentes en la comunidad. Sin embargo, la información de aislamientos resistentes en este contexto es limitada en Latinoamérica. Este estudio tiene como objetivo determinar la prevalencia y los factores de riesgo asociados con ITU de inicio en la comunidad (ITU-IC) causadas por Escherichia coli productor de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) en Colombia.

Materiales y métodos: Entre agosto y diciembre de 2011 se realizó un estudio de casos y controles en 3 instituciones de salud de tercer nivel en Colombia. Se invitó a participar a todos los pacientes admitidos a urgencias con diagnóstico probable de ITU-IC, y se les pidió una muestra de orina. En los aislamien-tos de E. coli se realizaron pruebas confirmatorias para BLEE, susceptibilidad antibiótica, caracterización molecular (PCR en tiempo real para genes bla, repetitive element palindromic PCR [rep-PCR], multilocus sequence typing [MLST] y factores de virulencia por PCR). Se obtuvo información clínica y epidemiológica, y posteriormente se realizó el análisis estadístico.

Resultados: De los 2.124 pacientes seleccionados, 629 tuvieron un urocultivo positivo, en 431 de estos se aisló E. coli, 54 fueron positivos para BLEE y 29 correspondieron a CTX-M-15.

La mayoría de los aislamientos de E. coli productor de BLEE fueron sensibles a ertapenem, fosfomicina y amikacina. La ITU complicada se asoció fuertemente con infecciones por E. coli productor de BLEE (OR = 3,89; IC 95%: 1,10–13,89; p = 0,03). E. coli productor de CTX-M-15 mostró 10 electroferotipos diferentes; de estos, el 65% correspondieron al ST131. La mayoría de estos aislamientos tuvieron 8 de los 9 factores de virulencia analizados.

Discusión: E. coli portador del gen blaCTX-M-15 asociado al ST131 sigue siendo frecuente en Colombia. La presencia de ITU-IC complicada aumenta el riesgo de tener E. coli productor de BLEE, lo cual debe tenerse en cuenta para ofrecer una terapia empírica adecuada.

Keywords: Betalactamasas; CTX-M-15; Colombia; Escherichia coli; Factores de riesgo; Infecciones del tracto urinario; Prevalence; Prevalencia; Risk factors; Urinary Tract Infections; β-Lactamases.

Publication types

  • Multicenter Study

MeSH terms

  • Adult
  • Case-Control Studies
  • Colombia / epidemiology
  • Community-Acquired Infections / epidemiology
  • Community-Acquired Infections / microbiology
  • Cross Infection / epidemiology*
  • Cross Infection / microbiology
  • Cross-Sectional Studies
  • Escherichia coli Infections / epidemiology*
  • Escherichia coli Infections / microbiology
  • Female
  • Humans
  • Male
  • Middle Aged
  • Multilocus Sequence Typing
  • Polymerase Chain Reaction / methods
  • Prevalence
  • Risk Factors
  • Urinary Tract Infections / epidemiology*
  • Urinary Tract Infections / microbiology
  • Uropathogenic Escherichia coli / enzymology*
  • beta-Lactamases / biosynthesis*

Substances

  • beta-Lactamases