Concentration and diversity of noroviruses detected in Luxembourg wastewaters in 2008-2009

Sylvain Skraber; Jérémie Langlet; Jacques R Kremer; Joël Mossong; Sébastien De Landtsheer; Jos Even; Claude P Muller; Lucien Hoffmann; Henry-Michel Cauchie

doi:10.1128/AEM.00632-11

Concentration and diversity of noroviruses detected in Luxembourg wastewaters in 2008-2009

Appl Environ Microbiol. 2011 Aug;77(15):5566-8. doi: 10.1128/AEM.00632-11. Epub 2011 Jun 24.

Authors

Sylvain Skraber¹, Jérémie Langlet, Jacques R Kremer, Joël Mossong, Sébastien De Landtsheer, Jos Even, Claude P Muller, Lucien Hoffmann, Henry-Michel Cauchie

Affiliation

¹ Dept. of Environment and Agro-biotechnologies (EVA), Centre de Recherche Public- Gabriel Lippman, 41 Rue du Brill, L-4422 Belvaux, Luxembourg.

Abstract

Noroviruses (NoV) in 78 wastewater samples from Luxembourg were quantified, cloned, and sequenced in 2008-2009. The concentrations of NoV genogroup II and the relative occurrences of certain genotypes changed significantly during the winter season. NoV genogroup I was frequently detected by real-time reverse transcription-PCR (RT-PCR), albeit at 30-fold lower concentrations than for genogroup II, hampering attempts to assess overall genetic diversity by the cloning/sequencing approach.

Publication types

Research Support, Non-U.S. Gov't

MeSH terms

Base Sequence
Caliciviridae Infections / genetics
Caliciviridae Infections / virology
Genotype
Luxembourg
Molecular Sequence Data
Norovirus / genetics
Norovirus / isolation & purification*
RNA, Viral / analysis
RNA, Viral / genetics
Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction
Sequence Analysis, RNA
Sewage / virology*

Substances

RNA, Viral
Sewage

Associated data

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