Molecular characterization of the VP1 gene of a Mexican isolate of infectious pancreatic necrosis virus

Can J Vet Res. 2010 Jul;74(3):218-22.

Abstract

The presence of infectious pancreatic necrosis virus (IPNV) in salmonids predominantly produces a high mortality rate in first-feeding fry. Genomic analysis of the vp2 gene sequence is most commonly used to determine the genetic diversity of IPNV isolates. Recently, information obtained from the vp1 gene allowed for efficient analysis of the genetic diversity of IPNV. In this study, the vp1 gene from a Mexican IPNV isolate was characterized and compared with IPNV isolates from Europe, North America, and Asia. The results indicate that the Mexican isolate is most closely related genetically to the 2310 strain from Spain.

La présence du virus de la nécrose pancréatique infectieuse (IPNV) chez les salmonidés entraîne de façon prédominante un taux de mortalité élevé chez les alevins. L’analyse génomique de la séquence du gène vp2 est la plus communément utilisée pour déterminer la diversité génétique des isolats d’IPVN. Récemment, des informations obtenues à partir du gène vp1 ont permis une analyse efficace de la diversité génétique d’IPVN. Dans la présente étude, le gène vp1 provenant d’un isolat mexicain d’IPVN a été caractérisé et comparé à des isolats d’IPVN provenant d’Europe, d’Amérique du Nord et d’Asie. Les résultats indiquent que, génétiquement, l’isolat provenant du Mexique se rapproche le plus de la souche 2310 provenant d’Espagne.

(Traduit par Docteur Serge Messier)

Publication types

  • Research Support, Non-U.S. Gov't

MeSH terms

  • Animals
  • Birnaviridae Infections / epidemiology
  • Birnaviridae Infections / veterinary
  • Birnaviridae Infections / virology
  • Capsid Proteins / genetics*
  • Capsid Proteins / metabolism*
  • Fish Diseases / epidemiology
  • Fish Diseases / virology
  • Gene Expression Regulation, Viral / physiology*
  • Genetic Variation
  • Infectious pancreatic necrosis virus / genetics*
  • Infectious pancreatic necrosis virus / metabolism*
  • Mexico / epidemiology
  • Oncorhynchus mykiss
  • Phylogeny

Substances

  • Capsid Proteins