Phylogenetic analysis of HIV-1 reverse transcriptase sequences from 382 patients recruited in JJ Hospital of Mumbai, India, between 2002 and 2008

AIDS Res Hum Retroviruses. 2009 Jun;25(6):633-5. doi: 10.1089/aid.2008.0261.

Abstract

Analysis of reverse transcriptase (RT) sequences of 382 HIV-1 isolates from untreated and treated patients recruited in JJ Hospital (Mumbai, India) between 2002 and 2008 shows that subtype C is largely predominant (98%) and that non-C sequences cluster with A1, B, CRF01_AE, and CRF06_cpx.

Publication types

  • Research Support, Non-U.S. Gov't

MeSH terms

  • Cluster Analysis
  • HIV Infections / epidemiology*
  • HIV Infections / virology*
  • HIV Reverse Transcriptase / genetics*
  • HIV-1 / genetics*
  • HIV-1 / isolation & purification
  • Hospitals
  • Humans
  • India / epidemiology
  • Molecular Epidemiology
  • Molecular Sequence Data
  • Phylogeny
  • Sequence Analysis, DNA
  • Sequence Homology

Substances

  • reverse transcriptase, Human immunodeficiency virus 1
  • HIV Reverse Transcriptase

Associated data

  • GENBANK/FJ530558
  • GENBANK/FJ530559
  • GENBANK/FJ530560
  • GENBANK/FJ530561
  • GENBANK/FJ530562
  • GENBANK/FJ530563
  • GENBANK/FJ530564
  • GENBANK/FJ530565
  • GENBANK/FJ530566
  • GENBANK/FJ530567
  • GENBANK/FJ530568
  • GENBANK/FJ530569
  • GENBANK/FJ530570
  • GENBANK/FJ530571
  • GENBANK/FJ530572
  • GENBANK/FJ530573
  • GENBANK/FJ530574
  • GENBANK/FJ530575
  • GENBANK/FJ530576
  • GENBANK/FJ530577
  • GENBANK/FJ530578
  • GENBANK/FJ530579
  • GENBANK/FJ530580
  • GENBANK/FJ530581
  • GENBANK/FJ530582
  • GENBANK/FJ530583
  • GENBANK/FJ530584
  • GENBANK/FJ530585
  • GENBANK/FJ530586
  • GENBANK/FJ530587
  • GENBANK/FJ530588
  • GENBANK/FJ530589
  • GENBANK/FJ530590
  • GENBANK/FJ530591
  • GENBANK/FJ530592
  • GENBANK/FJ530593
  • GENBANK/FJ530594
  • GENBANK/FJ530595
  • GENBANK/FJ530596
  • GENBANK/FJ530597
  • GENBANK/FJ530598
  • GENBANK/FJ530599
  • GENBANK/FJ530600
  • GENBANK/FJ530601
  • GENBANK/FJ530602
  • GENBANK/FJ530603
  • GENBANK/FJ530604
  • GENBANK/FJ530605
  • GENBANK/FJ530606
  • GENBANK/FJ530607
  • GENBANK/FJ530608
  • GENBANK/FJ530609
  • GENBANK/FJ530610
  • GENBANK/FJ530611
  • GENBANK/FJ530612
  • GENBANK/FJ530613
  • GENBANK/FJ530614
  • GENBANK/FJ530615
  • GENBANK/FJ530616
  • GENBANK/FJ530617
  • GENBANK/FJ530618
  • GENBANK/FJ530619
  • GENBANK/FJ530620
  • GENBANK/FJ530621
  • GENBANK/FJ530622
  • GENBANK/FJ530623
  • GENBANK/FJ530624
  • GENBANK/FJ530625
  • GENBANK/FJ530626
  • GENBANK/FJ530627
  • GENBANK/FJ530628
  • GENBANK/FJ530629
  • GENBANK/FJ530630
  • GENBANK/FJ530631
  • GENBANK/FJ530632
  • GENBANK/FJ530633
  • GENBANK/FJ530634
  • GENBANK/FJ530635
  • GENBANK/FJ530636
  • GENBANK/FJ530637
  • GENBANK/FJ530638
  • GENBANK/FJ530639
  • GENBANK/FJ530640
  • GENBANK/FJ530641
  • GENBANK/FJ530642
  • GENBANK/FJ530643
  • GENBANK/FJ530644
  • GENBANK/FJ530645
  • GENBANK/FJ530646
  • GENBANK/FJ530647
  • GENBANK/FJ530648
  • GENBANK/FJ530649
  • GENBANK/FJ530650
  • GENBANK/FJ530651
  • GENBANK/FJ530652
  • GENBANK/FJ530653
  • GENBANK/FJ530654
  • GENBANK/FJ530655
  • GENBANK/FJ530656
  • GENBANK/FJ530657
  • GENBANK/FJ530658
  • GENBANK/FJ530659
  • GENBANK/FJ530660
  • GENBANK/FJ530661
  • GENBANK/FJ530662
  • GENBANK/FJ530663
  • GENBANK/FJ530664
  • GENBANK/FJ530665
  • GENBANK/FJ530666
  • GENBANK/FJ530667
  • GENBANK/FJ530668
  • GENBANK/FJ530669
  • GENBANK/FJ530670
  • GENBANK/FJ530671
  • GENBANK/FJ530672
  • GENBANK/FJ530673
  • GENBANK/FJ530674
  • GENBANK/FJ530675
  • GENBANK/FJ530676
  • GENBANK/FJ530677
  • GENBANK/FJ530678
  • GENBANK/FJ530679
  • GENBANK/FJ530680
  • GENBANK/FJ530681
  • GENBANK/FJ530682
  • GENBANK/FJ530683
  • GENBANK/FJ530684
  • GENBANK/FJ530685
  • GENBANK/FJ530686
  • GENBANK/FJ530687
  • GENBANK/FJ530688
  • GENBANK/FJ530689
  • GENBANK/FJ530690
  • GENBANK/FJ530691
  • GENBANK/FJ530692
  • GENBANK/FJ530693
  • GENBANK/FJ530694
  • GENBANK/FJ530695
  • GENBANK/FJ530696
  • GENBANK/FJ530697
  • GENBANK/FJ530698
  • GENBANK/FJ530699
  • GENBANK/FJ530700
  • GENBANK/FJ530701
  • GENBANK/FJ530702
  • GENBANK/FJ530703
  • GENBANK/FJ530704
  • GENBANK/FJ530705
  • GENBANK/FJ530706
  • GENBANK/FJ530707
  • GENBANK/FJ530708
  • GENBANK/FJ530709
  • GENBANK/FJ530710
  • GENBANK/FJ530711
  • GENBANK/FJ530712
  • GENBANK/FJ530713
  • GENBANK/FJ530714
  • GENBANK/FJ530715
  • GENBANK/FJ530716
  • GENBANK/FJ530717
  • GENBANK/FJ530718
  • GENBANK/FJ530719
  • GENBANK/FJ530720
  • GENBANK/FJ530721
  • GENBANK/FJ530722
  • GENBANK/FJ530723
  • GENBANK/FJ530724
  • GENBANK/FJ530725
  • GENBANK/FJ530726
  • GENBANK/FJ530727
  • GENBANK/FJ530728
  • GENBANK/FJ530729
  • GENBANK/FJ530730
  • GENBANK/FJ530731
  • GENBANK/FJ530732
  • GENBANK/FJ530733
  • GENBANK/FJ530734
  • GENBANK/FJ530735
  • GENBANK/FJ530736
  • GENBANK/FJ530737
  • GENBANK/FJ530738
  • GENBANK/FJ530739
  • GENBANK/FJ530740
  • GENBANK/FJ530741
  • GENBANK/FJ530742
  • GENBANK/FJ530743
  • GENBANK/FJ530744
  • GENBANK/FJ530745
  • GENBANK/FJ530746
  • GENBANK/FJ530747
  • GENBANK/FJ530748
  • GENBANK/FJ530749
  • GENBANK/FJ530750
  • GENBANK/FJ530751
  • GENBANK/FJ530752
  • GENBANK/FJ530753
  • GENBANK/FJ530754
  • GENBANK/FJ530755
  • GENBANK/FJ530756
  • GENBANK/FJ530757
  • GENBANK/FJ530758
  • GENBANK/FJ530759
  • GENBANK/FJ530760
  • GENBANK/FJ530761
  • GENBANK/FJ530762
  • GENBANK/FJ530763
  • GENBANK/FJ530764
  • GENBANK/FJ530765
  • GENBANK/FJ530766
  • GENBANK/FJ530767
  • GENBANK/FJ530768
  • GENBANK/FJ530769
  • GENBANK/FJ530770
  • GENBANK/FJ530771
  • GENBANK/FJ530772
  • GENBANK/FJ530773
  • GENBANK/FJ530774
  • GENBANK/FJ530775
  • GENBANK/FJ530776
  • GENBANK/FJ530777
  • GENBANK/FJ530778
  • GENBANK/FJ530779
  • GENBANK/FJ530780
  • GENBANK/FJ530781
  • GENBANK/FJ530782
  • GENBANK/FJ530783
  • GENBANK/FJ530784
  • GENBANK/FJ530785
  • GENBANK/FJ530786
  • GENBANK/FJ530787
  • GENBANK/FJ530788
  • GENBANK/FJ530789
  • GENBANK/FJ530790
  • GENBANK/FJ530791
  • GENBANK/FJ530792
  • GENBANK/FJ530793
  • GENBANK/FJ530794
  • GENBANK/FJ530795
  • GENBANK/FJ530796
  • GENBANK/FJ530797
  • GENBANK/FJ530798
  • GENBANK/FJ530799
  • GENBANK/FJ530800
  • GENBANK/FJ530801
  • GENBANK/FJ530802
  • GENBANK/FJ530803
  • GENBANK/FJ530804
  • GENBANK/FJ530805
  • GENBANK/FJ530806
  • GENBANK/FJ530807
  • GENBANK/FJ530808
  • GENBANK/FJ530809
  • GENBANK/FJ530810
  • GENBANK/FJ530811
  • GENBANK/FJ530812
  • GENBANK/FJ530813
  • GENBANK/FJ530814
  • GENBANK/FJ530815
  • GENBANK/FJ530816
  • GENBANK/FJ530817
  • GENBANK/FJ530818
  • GENBANK/FJ530819
  • GENBANK/FJ530820
  • GENBANK/FJ530821
  • GENBANK/FJ530822
  • GENBANK/FJ530823
  • GENBANK/FJ530824
  • GENBANK/FJ530825
  • GENBANK/FJ530826
  • GENBANK/FJ530827
  • GENBANK/FJ530828
  • GENBANK/FJ530829
  • GENBANK/FJ530830
  • GENBANK/FJ530831
  • GENBANK/FJ530832
  • GENBANK/FJ530833
  • GENBANK/FJ530834
  • GENBANK/FJ530835
  • GENBANK/FJ530836
  • GENBANK/FJ530837
  • GENBANK/FJ530838
  • GENBANK/FJ530839
  • GENBANK/FJ530840
  • GENBANK/FJ530841
  • GENBANK/FJ530842
  • GENBANK/FJ530843
  • GENBANK/FJ530844
  • GENBANK/FJ530845
  • GENBANK/FJ530846
  • GENBANK/FJ530847
  • GENBANK/FJ530848
  • GENBANK/FJ530849
  • GENBANK/FJ530850
  • GENBANK/FJ530851
  • GENBANK/FJ530852
  • GENBANK/FJ530853
  • GENBANK/FJ530854
  • GENBANK/FJ530855
  • GENBANK/FJ530856
  • GENBANK/FJ530857
  • GENBANK/FJ530858
  • GENBANK/FJ530859
  • GENBANK/FJ530860
  • GENBANK/FJ530861
  • GENBANK/FJ530862
  • GENBANK/FJ530863
  • GENBANK/FJ530864
  • GENBANK/FJ530865
  • GENBANK/FJ530866
  • GENBANK/FJ530867
  • GENBANK/FJ530868
  • GENBANK/FJ530869
  • GENBANK/FJ530870
  • GENBANK/FJ530871
  • GENBANK/FJ530872
  • GENBANK/FJ530873
  • GENBANK/FJ530874
  • GENBANK/FJ530875
  • GENBANK/FJ530876
  • GENBANK/FJ530877
  • GENBANK/FJ530878
  • GENBANK/FJ530879
  • GENBANK/FJ530880
  • GENBANK/FJ530881
  • GENBANK/FJ530882
  • GENBANK/FJ530883
  • GENBANK/FJ530884
  • GENBANK/FJ530885
  • GENBANK/FJ530886
  • GENBANK/FJ530887
  • GENBANK/FJ530888
  • GENBANK/FJ530889
  • GENBANK/FJ530890
  • GENBANK/FJ530891
  • GENBANK/FJ530892
  • GENBANK/FJ530893
  • GENBANK/FJ530894
  • GENBANK/FJ530895
  • GENBANK/FJ530896
  • GENBANK/FJ530897
  • GENBANK/FJ530898
  • GENBANK/FJ530899
  • GENBANK/FJ530900
  • GENBANK/FJ530901
  • GENBANK/FJ530902
  • GENBANK/FJ530903
  • GENBANK/FJ530904
  • GENBANK/FJ530905
  • GENBANK/FJ530906
  • GENBANK/FJ530907
  • GENBANK/FJ530908
  • GENBANK/FJ530909
  • GENBANK/FJ530910
  • GENBANK/FJ530911
  • GENBANK/FJ530912
  • GENBANK/FJ530913
  • GENBANK/FJ530914
  • GENBANK/FJ530915
  • GENBANK/FJ530916
  • GENBANK/FJ530917
  • GENBANK/FJ530918
  • GENBANK/FJ530919
  • GENBANK/FJ530920
  • GENBANK/FJ530921
  • GENBANK/FJ530922
  • GENBANK/FJ530923
  • GENBANK/FJ530924
  • GENBANK/FJ530925
  • GENBANK/FJ530926
  • GENBANK/FJ530927
  • GENBANK/FJ530928
  • GENBANK/FJ530929
  • GENBANK/FJ530930
  • GENBANK/FJ530931
  • GENBANK/FJ530932
  • GENBANK/FJ530933
  • GENBANK/FJ530934
  • GENBANK/FJ530935
  • GENBANK/FJ530936
  • GENBANK/FJ530937
  • GENBANK/FJ530938
  • GENBANK/FJ530939
  • GENBANK/FJ530940