Prevalence and genetic characterization of hepatitis E virus in paired samples of feces and serum from naturally infected pigs

Can J Vet Res. 2007 Jul;71(3):236-40.

Abstract

This study describes the distribution of Hepatitis E virus (HEV) in a naturally infected swine population and the genetic relatedness of HEV strains on swine farms in Spain. Of fecal and serum samples collected from 131 pigs and manure-ditch samples collected from 17 farms, HEV was detected in 16%, 14%, and 59%, respectively, for an overall prevalence rate of 23%. The maximum prevalence rates for feces and serum were in pigs 5 to 12 wk old. A high prevalence of the virus in feces (18%) was observed in sows. Gene sequencing was performed on 6 strains from feces, serum, and manure ditch: the nucleotide identities varied from 81.5% to 99% when compared with those of other strains of genotype 3 isolated from swine. This is the first study in Europe to show the variation in virus distribution by age in feces and serum in a naturally infected swine population.

Cette étude décrit la distribution du virus de l’hépatite E (HEV) dans une population de porcs naturellement infectés et la parenté génétique de souches de HEV provenant de fermes porcines en Espagne. À partir d’échantillons de fèces et de sérum prélevés de 131 porcs, et de fosses à purin sur 17 fermes, le HEV a été détecté, respectivement, dans 16 %, 14 % et 59 % des échantillons, pour une prévalence globale de 23 %. Les taux maximums de prévalence pour les fèces et le sérum ont été retrouvés chez les porcs de 5 à 12 semaines d’âge. Une prévalence élevée de virus dans les fèces (18 %) a été observée chez les truies. Le séquençage génétique a été effectué sur 6 isolats provenant des fèces, du sérum et de fosse à purin : l’identité nucléotidique a varié de 81,5 % à 99 % en comparaison avec d’autres souches du génotype 3 isolées de porcs. Il s’agit de la première étude européenne à démontrer la variation de la distribution du virus selon l’âge dans les fèces et le sérum d’une population de porcs infectés naturellement.

(Traduit par Docteur Serge Messier)

Publication types

  • Research Support, Non-U.S. Gov't

MeSH terms

  • Animals
  • Base Sequence
  • Feces / virology*
  • Female
  • Genotype
  • Hepatitis E / blood
  • Hepatitis E / epidemiology
  • Hepatitis E / veterinary*
  • Hepatitis E / virology
  • Hepatitis E virus / classification
  • Hepatitis E virus / isolation & purification*
  • Male
  • Manure / virology
  • Molecular Sequence Data
  • Phylogeny
  • Prevalence
  • Sequence Alignment
  • Swine
  • Swine Diseases / blood
  • Swine Diseases / epidemiology*
  • Swine Diseases / virology*
  • Virus Shedding

Substances

  • Manure

Associated data

  • GENBANK/DQ093564
  • GENBANK/DQ093565
  • GENBANK/DQ093566
  • GENBANK/DQ093567
  • GENBANK/DQ093568
  • GENBANK/DQ093569